El estatuto de la UNPSJB indica con claridad cuáles son las funciones que debe desarrollar en tanto institución de Educación Superior, entre ellas la de gobernarse a sí misma. Los principios de la autonomía se encuentran expresados en el Título I, Art. No 3, Principios constitutivos en donde se expresa que “define sus órganos de gobierno estableciendo sus funciones y decidiendo sobre su integración”, quedando habilitado de esta manera un conjunto de representaciones, principios, instituciones, reglamentaciones, procesos, prácticas y mecanismos constituyentes de lo político.
Todo un conjunto de dispositivos que intentan articular una distribución del poder según los objetos de transformación (rectorado y facultades), los estamentos sociopolíticos que gozan de derechos como ciudadanos universitarios (docentes, estudiantes, graduados y nodocentes), la representación territorial (sedes) y de las organizaciones sociales de la región (consejo social).
La Universidad sostiene una política de fortalecimiento institucional asociada al espacio social donde despliega sus funciones y actividades. Esta imbricación debe permitir su inserción en los planes locales y regionales que contribuyen al desarrollo endógeno de las comunidades. De esta manera se promoverá un conocimiento situado, a partir de un diálogo directo con los agentes que comparten las mismas experiencias, que producirá un efecto estructural potenciador sobre sobre la universidad y los grupos sociales patagónicos.